Offentlig anbud · Intensjonskunngjøring
Tildelt
Offentlig anbud · IntensjonskunngjøringReagenser til PCR-fri bibliotekspreparering for helgenomsekvensering ved Oslo universitetssykehus HF
Oppdragsgiver: SYKEHUSINNKJØP HF
- Status
- Tildelt
- Publisert
- 25.9.2026
- Tilbudsfrist
- Ikke oppgitt
- Estimert verdi
- Ikke oppgitt
- Sted
- Oslo
- Delkontrakter
- 1
- Kunngjørings-ID
- 2026-114987
Tildelt til
- Watchmaker Genomics
Om anskaffelsen
Reagenser til PCR-fri bibliotekspreparering for helgenomsekvensering
Kjøper▾
- Offisielt navn
- SYKEHUSINNKJØP HF
- Juridisk type kjøper
- Offentligrettslig organ
- Oppdragsgivers virksomhet
- Helse
Prosedyre▾
- Tittel
- Reagenser til PCR-fri bibliotekspreparering for helgenomsekvensering ved Oslo universitetssykehus HF
- Beskrivelse
- Reagenser til PCR-fri bibliotekspreparering for helgenomsekvensering
- Prosedyreidentifikator
- 5f6b947b-69d9-4990-9b5f-7e70be33bf3d
- Type prosedyre
- Konkurranse med fohandling uten forutgående kunngjøring
- Hensikt – Kontraktens art
- Varer
- Hensikt – Hoved klassifisering
- Medisinsk utstyr, legemidler og utstyr til personlig pleie
- Sted for gjennomføring – Underenhet i land
- Oslo (NO081)
- Sted for gjennomføring – Land
- Norge
Delkontrakt LOT-0001▾
- Tittel
- Intensjonskunngjøring: Reagenser til PCR-fri bibliotekspreparering for helgenomsekvensering til Oslo universitetssykehus HF
- Beskrivelse
- Oslo universitetssykehus har til hensikt å inngå rammeavtale for reagenser til PCR-fri bibliotekspreparering for helgenomsekvensering. Kontrakten inngås etter anskaffelse uten konkurranse iht. anskaffelsesforskriftens §13-4 bokstav b.
- Hensikt – Kontraktens art
- Varer
- Hensikt – Hoved klassifisering
- Medisinsk utstyr, legemidler og utstyr til personlig pleie
- Sted for gjennomføring – Underenhet i land
- Oslo (NO081)
- Sted for gjennomføring – Land
- Norge
- Anskaffelsen er omfattet av avtalen om offentlige anskaffelser (GPA)
- Ja
- Nærmere informasjon, mekling og revisjon – Meklingsvirksomhet
- Indre og Østre Finnmark Tingrett -
- Nærmere informasjon, mekling og revisjon – Virksomhet som gjennomfører klagebehandling
- SYKEHUSINNKJØP HF -
- Nærmere informasjon, mekling og revisjon – Virksomhet som gir mer informasjon om klagebehandling
- SYKEHUSINNKJØP HF -
Resultater▾
- Begrunnelse for direkte tildeling
- Kontrakten kan bare leveres av en bestemt markedsdeltaker på grunn av fravær av konkurranse av tekniske årsaker
- Annen begrunnelse
- Avdeling for medisinsk genetikk (AMG) ønsker å tilby helgenomsekvensering (WGS) som metode for diagnostiske undersøkelser av pasientprøver med lite DNA, inkludert foster i pågående svangerskap. Det er svært fordelaktig for resultater av WGS at DNA ikke amplifiseres, altså en PCR-fri metode. Det er også svært fordelaktig for arbeidsflyt at samme metode for bibliotekspreparering benyttes for alle prøver hvor det skal utføres WGS. Det er derfor behov for reagenser til PCR-fri bibliotekspreparering for alle prøver hvor det skal utføres WGS. Biblioteksprepareringsmetoden (heretter metoden) skal være robust, automatiserbar og gi reproduserbare resultater med lav startmengde DNA. Metoden skal yte høy konverteringsrate fra DNA til ferdig sekvenserbare biblioteker, høy bibliotekskompleksitet og jevn genomdekning. Behovshaver har følgende absolutte krav til metoden: 1. Metoden skal være PCR-fri for å unngå introduksjon av PCR-artefakter i bibliotekene. 2. Metoden skal være kompatibel med DNA fra blodprøver samt DNA fra andre prøvematerialer som mottas for analysering. En andel prøver har svært begrenset mengde DNA. Eksempler på prøvematerialer er (ikke begrenset til) vevsspesifikke biopsier, urinprøver, slimhinne samt prenatale prøver fra morkake og fostervann (dyrkede og udyrkede celler). 3. Metoden skal grunnet variasjon i prøvematerialet (kfr foregående punkt) ha en standardisert arbeidsflyt for ulik startmengde (input) av genomisk DNA i biblioteksprepareringen Det skal ikke være ulik protokoll for prøver med lav input og prøver med høyere input i biblioteksprepareringen. Arbeidsflyten skal være identisk for startmengder mellom 75 og 500 ng. Metoden skal ha høy konverteringsrate av DNA til ferdig bibliotek, og høyest mulig molaritet på ferdige biblioteker. 4. Variabel input (jfr foregående punkt) skal ikke påvirke kvalitet på sluttresultatet. De viktigste parametere for sluttresultatet er høy jevnhet i genomdekning (coverage uniformity) med minimale sekvensavhengige skjevheter (GC- og AT-bias), samt optimal lengde av sekvenserte fragmenter i bibliotekene (flest mulig fragmenter med insert size 300-400 basepar). Det er ønskelig med høyest mulig utnyttelse av sekvenseringskapasitet. Andre kvalitetsparametere av betydning er derfor renest mulig biblioteker (lave mengder frie adaptere og adapter-dimere, lav mengde av prepareringsrelaterte artefakter som kimære fragmenter og hairpin-strukturer) og færrest mulig fragmentduplikater ved sekvensering. 5. Metoden skal benytte enzymatisk fragmentering av DNA. Den enzymatiske fragmenteringen skal være robust og justerbar, og levere reproduserbare, konsistente størrelser på bibliotekene uavhengig av DNA-input (75-500 ng, jfr foregående punkter). Mekanisk fragmentering (sonikering) er ikke ønskelig, da vi grunnet svært høye analysevolumer ønsker en enkel og fullt automatiserbar protokoll. Mekanisk fragmentering krever spesialutstyr og forbruksvarer som driver kostnader opp og introduserer sårbarhet for instrumentfeil. Det er heller ikke ønskelig med tagmentering (transposase-mediert DNA-fragmentering og merking) da dette produserer biblioteker med lavere kompleksitet enn enzymatisk fragmentering. 6. Metoden skal benytte ligeringsbasert kjemi, med endereparasjon, A-tailing og fullengde-adapterligering, og være kompatibel med sekvenseringsteknologien XLEAP-SBS fra Illumina. Endereparasjon av fragmentert DNA øker konverteringsraten, og dermed sannsynligheten for å oppnå resultater som tilfredsstiller våre krav til kvalitet ved variabel DNA-input. Fullengde-adaptere inneholder komplette primerbindingssteder, fullstendige indekser og flowcelle-bindingssekvenser allerede ved ligeringstrinnet og muliggjør produksjon av sekvenseringsklare biblioteker uten behov for PCR-amplifisering. 7. Metoden skal ha en arbeidsflyt som gjør det mulig å produsere ferdige biblioteker på under 90 minutter ved manuell arbeidsflyt. 8. Metoden skal kunne automatiseres med Hamilton NGS STAR og NGS STAR V liquid handling-roboter, samt SPT Labtech Firefly+ roboter. 9. Kit-størrelsen skal være tilstrekkelig for bibliotekspreparering av minimum 96 prøver, og skal inkludere dødvolum av alle reagenser, slik at kitet er kompatibelt med automatiserte oppsett på robot.
Virksomheter ORG-0001▾
- Offisielt navn
- SYKEHUSINNKJØP HF
- Organisasjonsnummer
- 916879067
- By
- Vadsø
- Postnummer
- 9811
- Underenhet i land
- Finnmark/Finnmárku/Finmarkku (NO073)
- Land
- Norge
- E-post
- post@sykehusinnkjop.no
- Telefon
- 78950700
Virksomheter ORG-0002▾
- Offisielt navn
- Indre og Østre Finnmark Tingrett
- Organisasjonsnummer
- 926722840
- By
- Vadsø
- Postnummer
- 9800
- Underenhet i land
- Finnmark/Finnmárku/Finmarkku (NO073)
- Land
- Norge
- E-post
- indre.og.ostre.finnmark.tingrett@domstol.no
- Telefon
- 78011700
Virksomheter ORG-0003▾
- Offisielt navn
- Watchmaker Genomics
- Organisasjonsnummer
- 13677588
- By
- London
- Postnummer
- EC3V 9AA
- Land
- Storbritania
- E-post
- sales.emea@watchmakergenomics.com
Kilde: Doffin, Norges nasjonale kunngjøringsdatabase. Oppdateres hver time. Sist hentet 25. sep. 2026, 14:03.